乳鐵蛋白被美國FDA列為是公認安全的物質（generally recognized as a safe substance; GRAS)，但實際上每天該吃多少劑量，並沒有定義得很清楚。臨床上證實每天吃7.2克，長達八周，都是安全的。如果每天吃超過7.2克可能會有下痢，皮疹、缺乏食欲、噁心、疲勞、便秘、腹痛及怕冷等副作用。
為了搞清楚到底該吃多少乳鐵蛋白，
整理了乳鐵蛋白相關的臨床研究，歸納出一個結論：乳鐵蛋白補充的方式可以分成兩種；第一種是當成日常保健的營養補充品，每天的劑量可以是100-300mg，也就是台灣衛福部規定的每日上限是300mg；另一種就是當成治療藥物，在短時間內使用高劑量，用來治療或緩解疾病，所需的劑量依照不同的疾病而有差異。有趣的是，早期的臨床研究大部分都是針對早產兒或嬰幼兒的敗血症或下痢，後來才慢慢擴及到各式各樣的疾病。